Erilaisista kasvihuonerakennusmateriaaleista johtuen myös niiden lämmönjohtavuus ja eristysominaisuudet ovat erilaisia. Materiaalit, joilla on suhteellisen korkea lämmönjohtavuus, ovat alttiita lämmönsiirrolle. Kutsumme yleensä alueita, joiden eristyskyky on huonompi, "kylmäsiltoina". Kylmäsilta-alue on pääkanava lämmönjohtamiselle ja myös paikka, jossa kondenssivettä syntyy helposti. Ne ovat eristyksen heikko lenkki. Siksi toimenpiteiden toteuttaminen kylmäsillan lämpöhäviön vähentämiseksi on keino säästää energiaa ja säilyttää lämpöä kasvihuoneessa. Pätevän kasvihuoneen tulee kiinnittää huomiota näiden kylmäsiltojen käsittelyyn rakentamisen aikana.
Moniväliisen kasvihuoneen kouru yhdistää kattoa ja kerää sadeveden ja viemärin. Kourut on enimmäkseen valmistettu teräksestä tai metalliseoksesta, ja niiden eristyskyky on heikko ja lämpöhäviö on huomattava. Kouru vie alle 5 % kasvihuoneen pinta-alasta, mutta lämpöhäviö on yli 9 %. Siksi vesikourujen eristyksen vaikutusta energiansäästöön ja kasvihuoneen eristykseen ei voida jättää huomiotta. Tällä hetkellä kourujen eristysmenetelmiä ovat onttojen rakennemateriaalien käyttö yksikerroksisten metallimateriaalien sijaan sekä ilmakerroseristyksen hyödyntäminen; Toinen on eristekerroksen levittäminen yksikerroksisen materiaalikourun pinnalle.
Tiiliseiniin verrattuna maanalaiset kehäpalkit ja matalien seinien yläosassa olevat kehäpalkit ovat myös lämpöä ulospäin siirtäviä alueita. Lisäksi, kun seinän paksuus ei ole suuri, maanalainen maakerros on myös tärkeä kanava perustusten lämpöhäviöille. Siksi kasvihuoneen rakentamisessa eristekerroksen (5 cm paksu vaahtopolystyreenilevy tai 3 cm paksu polyuretaanivaahtolevy) asettaminen perustusten ja lyhyen seinän ulkopuolelle on hyvä toimenpide maan lämpötilan ylläpitämiseksi kasvihuoneen suunnittelussa ja rakentamisessa pohjoisessa. Aurinko- tai vihanneskasvihuoneeseen voidaan myös kaivaa kasvihuoneen ympärille kylmänkestäviä ojia, joiden syvyys on 0.5-1.0m ja leveys 0,5 m. pohjaa pitkin ja täytetty eristysmateriaaleilla maan lämpötilan alenemisen katkaisemiseksi.
